Akıllı kartların yaygınlaşması bir çok güvenlik açığının da ortaya çıkmasına neden olmuştur. Güvenlik açıkları kartın kendisinden kaynaklanabileceği gibi , kullanılan POS kart okuyucu ve yazılımdan kaynaklanabilir. Proje kapsamında güvenlik açıklarının oluşabileceği tüm katmanlarda gerekli test ve kontroller yapılarak sistemin sorunsuz çalışması sağlanır.